التنبؤ بتآثر بروتين-بروتين (Protein–protein interaction prediction) هو مجال يجمع بين المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء البنيوي في محاولةٍ لتحديد وفهرسة التآثرات الفيزيائية بين أزواج أو مجموعات البروتينات. فهم تآثرات البروتين-بروتين مهم في سبيل تقصي مسارات التأشير داخل الخلوية، نمذجة وتحديد بنُى المركبات البروتينية وللحصول على رؤىً وأفكارٍ حول مختلف العمليات البيوكيميائية.
تجريبيا، يمكن استنتاج التآثرات الفيزيائية بين أزواج البروتينات من خلال العديد من التقنيات منها: أنظمة الهجينين الخميري، مقايسة تتام القطعة البروتينية (PCA)، التنقية حسب الألفة/ مطيافية الكتلة، مصفوفات البروتين الدقيقة، انتقال طاقة رنين فورستر (FRET) والرحلان الحراري ميكروي النطاق (MST). هنالك مجهودات جارية لتحديد التآثروم الخاص بالعديد من الأجناس. عادة ما توفر التآثرات المحدَّدَة تجريبيا الأساس للتقنيات الحاسوبية للتنبؤ بالتآثرات المماثلة والشبيهة، على سبيل المثال: استخدام تسلسل بروتيني متماثل بين عدة أجناس. مع ذلك توجد طرق تتنبؤ بتآثرات جديدة من دون وجود معلومات سابقة حول تآثرات مماثلة.
مراجع
- Raman, Karthik (2010-02-15). "Construction and analysis of protein–protein interaction networks". Automated Experimentation. 2 (1): 2. doi:10.1186/1759-4499-2-2. ISSN 1759-4499. PMC . PMID 20334628.