الرئيسيةعريقبحث

تواصل سريع


FastContact هي خوارزمية للتخمين السريع للملامسات و الملزمة للبنيات المعقدة المكونة من ويستند إلى إمكانات إبطال للإزالة محسوبة إحصائياً وكهرباءكهربائية كولومبية مع ثابت كهربي عكسي تعتمد على المسافة. كما يشير التطبيق إلى بقايا طاقات الاتصال الحر. تسليط الضوء على النقاط الساخنة للتفاعل.

تمت كتابة البرنامج في Fortran 77 بواسطة كارلوس ج. كاماتشو وتشاو تشانغ في قسم علم الأحياء الحاسوبي ، جامعة بيتسبيرج ، PA. [1] تم إنشاء خادم ويب لتشغيل الاتصال السريع عبر الإنترنت أو تنزيل الملف الثنائي بواسطة P. Christoph تشامبين يوليو 2005.

المراجع

Camacho CJ, Zhang C (2005). "FastContact: rapid estimate of contact and binding free energies". Bioinformatics. 21 (10): 2534–2536. doi:10.1093/bioinformatics/bti322. PMID 15713734.

  • Camacho CJ, Ma H, Champ PC (2006). "Scoring a diverse set of high-quality docked conformations: A metascore based on electrostatic and desolvation interactions". Proteins. 63 (4): 868–877. doi:10.1002/prot.20932. PMID 16506242.
  • Champ PC, Camacho CJ (2007). "FastContact: a free energy scoring tool for protein-protein complex structures". Nucleic Acids Res. 35 (Web addition): W556–60. doi:10.1093/nar/gkm326. PMC 1933237. PMID 17537824.

روابط خار جية

  • FastContact binaries — binaries are freely available for download (with documentation).
  • FastContact Server — set up by P. Christoph Champ in July 2005.
  • FastContact Wiki

موسوعات ذات صلة :