علم أحياء المياه العذبة (Freshwater biology) هو فرع من فروع علم المياه العذبة يَهتم بدراسة النظام الإيكولوجي للمياه العذبة دراسة علمية بيولوجية, وذلك بفهم العلاقة بين الكائنات الحية في المياه العذبة والبيئة الكيميائية والفيزيائية المحيطة بها, فالعمليات الصناعية مثل تنقية المياه و معالجة مياه الصرف الصحي[1] تتم باستخدام ضوابط بيولوجية.
تُعد الولايات المتحدة أول منطقة تهتم بهذا العلم حيث أنشأت جمعية بيولوجية للمياه العذبة [2] في كومبريا.