الرئيسيةعريقبحث

قاعدة بيانات جالفيو


جالفيو هو مجموعة من البرمجيات المعلوماتية الحيوية التي يتم استخدامها لاستكشاف وتحرير تراصفات تسلسلية متعددة، وهو مكتوب بلغة البرمجة جافا ,وقد كتب البرنامج في الأصل من قبل ميشيل كلامب بينما كان يعمل في مجموعة جيوف بارتون في المعهد، وهو نسخة معاد هندستها من إنتاج أندرو ووترهاوس وجيم بروكتر بينما كان يعمل في مجموعة جيوف بارتون في جامعة دندي ,في عام 2005 ,وتدعم تطويرها من قبل مجلس بحوث التكنولوجيا الحيوية والعلوم البيولوجية، يتم استخدامه على نطاق واسع من قبل مجموعة متنوعة من خوادم الويب (على سبيل المثال خادم معهد المعلوماتية الحيوية الأوروبي كلوستال ClustalW وقاعدة بيانات مجال بروتين بفام) ,ولكن يتوفر كمحرر مواءمة للأغراض العامة. جالفيو لديها مجموعة واسعة من الوظائف بالإضافة إلى تسلسل متعددة، محاذاة عرض وتحرير  بما في ذلك حساب شجرة التطور  ,  وعرض الهياكل الجزيئية، العديد من هذه تستخدم خدمات الويب الخارجية لاستيراد البيانات.

Jalview
Non-homologous exon alignment.jpg
لقطة شاشة
معلومات عامة
نوع
Bioinformatics tool
موقع الويب
معلومات تقنية
المطورون
Andrew Waterhouse, James Procter, David Martin and Geoffrey Barton at the جامعة دندي.
Original version by Michele Clamp, James Cuff, Stephen Searle, Geoffrey Barton.

المراجع

  1. "Release History". مؤرشف من الأصل في 6 مارس 2019.

1.تاريخ الإصدار ".

2.Clamp M, Cuff J, Searle SM, Barton GJ (February 2004). "The Jalview Java alignment editor". Bioinformatics20 (3): 426–7. معرف الوثيقة الرقمي:10.1093/bioinformatics/btg430ببمد 14960472.

3. Waterhouse AM, Procter JB, Martin DM, Clamp M, Barton GJ (May 2009). "Jalview Version 2--a multiple sequence alignment editor and analysis workbench"Bioinformatics25 (9): 1189–91. معرف الوثيقة الرقمي:10.1093/bioinformatics/btp033ببمد سنترال 2672624ببمد 19151095.

موسوعات ذات صلة :