Habitat

Shigella flexneri

Les Shigella ne font partie d'aucune flore commensale chez l'être humain, elles sont toutes pathogènes et spécifiques du tube digestif ; éliminées par les selles et dispersées dans les sols et les eaux où elles ne survivent que peu de temps.

Pouvoir pathogène

Elles sont responsables des shigelloses (infections intestinales affectant spécifiquement les primates), qui sont des dysenteries bacillaires transmises par l'eau de boisson et les aliments souillés par les selles des malades ou porteurs chroniques. Il s'agit d'infections intestinales localisées essentiellement au gros intestin où les germes se multiplient en provoquant une inflammation de la muqueuse se traduisant par une diarrhée glaireuse et sanguinolente. Il n'y a pas d'essaimage dans la circulation mais les phénomènes locaux peuvent s'accompagner de toxicose et de déshydratation.

L'espèce la plus mise en cause est Shigella dysenteriae ou bacille de Shiga. Shigella dysenteriae est responsable de formes graves dans les régions tropicales (Asie et Amérique Centrale). C'est la seule shigelle qui sécrète une exotoxine.

Les autres espèces de Shigella sont également responsables de diarrhées aigües. En revanche, leurs infections sont généralement plus bénignes et s'accompagnent de symptômes atténués. Dans certaines formes chroniques, les périodes de diarrhées alternent avec des périodes asymptomatiques.

On rencontre ces infections essentiellement en Europe, pour lesquelles Shigella flexneri (groupe cosmopolite causant des épidémies et des cas sporadiques de gravité variable) et sont le plus souvent mises en cause. Dans un pays comme la France, Shigella sonnei est la plus fréquente, isolée dans 70 % des cas. Elle est généralement la cause d'entérites bénignes qui touchent particulièrement les enfants et parfois de petites épidémies de crèches ou d'écoles.

Morphologie microscopique

Aspect : Ce sont des bacilles Gram négatifs, immobiles ; dépourvus de spores. Certaines souches de certaines espèces peuvent être dotées d'une capsule (antigène K)^{[3],[4],[5],[6]}.

Groupement : Variable, ils se présentent isolés, en diplobacilles et parfois même en chaînettes.

Caractère de culture

Caractère biochimique

Il se détermine sur une galerie classique ou miniaturisée pour Enterobacteriaceae avec laquelle elles se différencient par un ensemble de caractères négatifs :

• absence d'uréase, de désaminase et de lysine décarboxylase ;
• absence de production de H₂S et d'acétoïne ;
• pas d'utilisation du citrate comme seule source de carbone sur milieu citrate de Simmons ;
• immobiles.

Les caractères ONPG, mannitol, indole et ODC varient selon les biotypes (voir le tableau ci-dessus).