الأوليغومايسينات (Oligomycins) هي ماكروليدات تنشأ من البكتيريا المتسلسلة ويمكن أن تكون سامة لكائنات حية أخرى.
أوليغومايسين A | |
---|---|
الاسم النظامي (IUPAC) | |
(1R,4E,5'S,6S,6'S,7R,8S,10R,11R,12S,14R,15S,16R,18E,20E,22R,25S,27R,28S,29R)-22-ethyl-7,11,14,15-tetrahydroxy-6'-[(2R)-2-hydroxypropyl]-5',6,8,10,12,14,16,28,29-nonamethyl-3',4',5',6'-tetrahydro-3H,9H,13H-spiro[2,26-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-4,18,20-triene-27,2'-pyran]-3,9,13-trione |
|
أسماء أخرى | |
Oligomycin |
|
المعرفات | |
رقم CAS | 1404-19-9 |
بوب كيم (PubChem) | 6450197 |
الخواص | |
الكتلة المولية | 791.062 غ/مول. |
المخاطر | |
صحيفة بيانات سلامة المادة | MSDS at Fermentek |
في حال عدم ورود غير ذلك فإن البيانات الواردة أعلاه معطاة بالحالة القياسية (عند 25 °س و 100 كيلوباسكال) |
الوظيفة
يستخدم كمضاد حيوي.
اوليغومايسن A عبارة عن مثبط لإنزيم تصنيع الطاقة. في أبحاث الفسفتة الاكسيدية، يستخدم لإيقاف المرحلة الثالثة للتنفس الخلوي. يقوم اوليغومايسن A بتثبيط إنزيم تصنيع الطاقة عن طريق سد قناته البروتونية التي تعمل على تحويل ال ADP →ATP .
إن تثبيط تصنيع الطاقة من قبل اوليغومايسن A يؤدي إلى خفض سريان الإلكترونات عبر سلسلة نقل الإلكترون، لكن لا يتوقف سريان الإلكترونات تماما بسبب عملية تسمى ب تسرب البروتونات أو عن طريق فك ربط المايتوكندريا[1]. هذه العملية تحدث نتيجة الانتشار الميسر للبروتونات إلى قالب المايتوكندريا بمساعدة بروتين فك ربط مثل الثرموجينين.
قد يؤدي تعاطي اوليغومايسن إلى نسب عالية من اللاكتات متراكمة في الدم والبول.
R1 | R2 | R3 | R4 | R5 | |
Oligomycin A | CH3 | H | OH | H,H | CH3 |
Oligomycin B | CH3 | H | OH | O | CH3 |
Oligomycin C | CH3 | H | H | H,H | CH3 |
Oligomycin D (Rutamycin A) |
H | H | OH | H,H | CH3 |
Oligomycin E | CH3 | OH | OH | O | CH3 |
Oligomycin F | CH3 | H | OH | H,H | CH2CH3 |
Rutamycin B | H | H | H | H,H | CH3 |
44-Homooligomycin A | CH2CH3 | H | OH | H,H | CH3 |
44-Homooligomycin B | CH2CH3 | H | OH | O | CH3 |
موقع ارتباط - الاوليجومايسن
اوليجومايسن معترف به كمثبط فاعل لانزيم الATP سينثاز في المتكندريا منذ عام 1958 عندما تم إفادته من قبل هينري لاردي (henry lardy et al) [3].
في ستينات القرن العشرين تمت درسات في مختبر افرايم راكر (EfraimRacker) أظهرت أن أنزيم الATP سينثاز في المتوكندريا يمكن تقسيمه إلى جزئين f1
(coupling factor 1/عامل اقتران 1 )
الذي يحتوي موقع التحفيز لتصنيع ال ATP ، وf0
( coupling factor 0/ عامل اقتران 0 )
الجزء الذي يكون حساساً للاوليجومايسن [4][5]، ولكن بالرغم من 50 سنة من الدراسات على f1f0 للATP سنثازفي المتكندريا ، لم تستطع فهم حقيقة ارتباط الاوليجومايسن بالجزء f0 . لذلك تم اقتراح ، وجود موقع ارتباط للاليجومايسن على الوحدة الفرعية (c (subunit-c على الجزء f0 من ال ATP سينثاز ، هذه الوحدة الفرعية هي عبارة عن بروتين غشائي أساسي ، تتكون من حِلْزين 1و 2 ، تعبران الغشاء الداخلي للمتكندريا . الوحدة الفرعية c ، والتي يتم تمثل حلقات متشابهة تتكون من 10 وحدات فرعية في ال ATP سينثاز في الخميرة وثمانية وحدات فرعية في ال ATP سينثاز في البقر [6][7] . حلقة ال(c (c-ring تعتبر مكون أساسي في محرك التربين للبروتاونات في ATP سينثاز ، والمقترن في حركة ال البروتونات مع تدرج الجهد . وقد افتُرض أن الكربوكسيل الأساسي ل Glu59 في الحِلِزُّ 2 من الوحدة الفرعية c في الخميرة يشارك مباشرة في حركة البروتونات من السايتوسول إلى مَطْرِسُ المتكندريا (mitochondrial matrix) خلال تصنيع ال ATP . توجد السلسلة الكاربوكسيل الجانبية لل Glu59 في منتصف الِحلز 2 ، مما يضعها في طبقة الليبيد الثنائية على شكل بروتوني مغلق . [8]
بينما افتُرض ان الوحدة الفرعية (a (subunit-a تشكل اثنان من القنوات النصفية الذائبة (aqueous half-channles) ، والتي تسمح للبروتونات بالوصول إلى كربوكسيل ال Glu59 في شكل السلسلة المفتوح ، والذي بدوره يسمح بعمليات إضافة وإزالة البروتونات (protonation and deprotonation) .
و على هذه الأساس تم اقتراح أنه في الATP سنثاز السليم ، يرتبط الاوليجومايسن بالحلقة c الواقعة في قنوات البروتونات ، والذي بدوره يقوم بإيقاف الحركة الإنتقالية للبروتونات ، عن طريق منع الوصول للكربوكسيل الأساسي . وتم اقتراح أيضاً أن موقع الارتباط المؤطر في الاوليجومايسن ،هو موقع ارتباط لأي دواء مثبط يرتبط في الحلقة c للبكتيريا ، والمثبطات التي ترتبط في v0 (مضاهي لf0 ) لانزيم ال ATPase . بسبب سعة الانتشار لهذه المثبطات . ومن المحتمل أن يمثل موقع الارتباط للاوليجومايسن ، قاعدة أساسية لتطور الأدوية في المستقبل [9]
المراجع
- Jastroch M, Divakaruni AS, Mookerjee S, Treberg JR, Brand MD (2010). "Mitochondrial proton and electron leaks". Essays in biochemistry (47): 53–67. doi:10.1042/bse0470053. PMID 20533900.
- Nakata, Masaya; Ishiyama, Takashi; Akamatsu, Shinichi; Hirose, Youichi; Maruoka, Hiroshi; Suzuki, Rika; Tatsuta, Kuniaki (1995). "Synthetic studies on oligomycins. Synthesis of the oligomycin B spiroketal and polypropionate portions". Bulletin of the Chemical Society of Japan. 68 (3): 967–89. doi:10.1246/bcsj.68.967.
- 3.Lardy HA, Johnson D, McMurray WC (1958) Antibiotics as tools for metabolic studies.I. A survey of toxic antibiotics in respiratory, phosphorylative and glycolytic systems.ArchBiochemBiophys 78:587–597.
- 4.Racker E (1963) A mitochondrial factor conferring oligomycin sensitivity on solublemitochondrial ATPase. BiochemBiophys Res Commun 10:435–439.
- 6.Kagawa Y, Racker E (1966) Partial resolution of the enzymes catalyzing oxidativephosphorylation. 8. Properties of a factor conferring oligomycinsensitivity on mitochondrialadenosine triphosphatase. J BiolChem 241:2461–2466.
- 7.Watt IN, Montgomery MG, Runswick MJ, Leslie AG, Walker JE (2010) Bioenergetic costof making an adenosine triphosphate molecule in animal mitochondria. Proc NatlAcadSci USA 107:16823–16827.
- 8.Stock D, Leslie AGW, Walker JE (1999) Molecular architecture of the rotary motor inATP synthase. Science 286:1700–1705.
- 9.Pogoryelov D, et al. (2010) Microscopic rotary mechanism of ion translocation in theF(o) complex of ATP synthases. Nat ChemBiol 6:891–899.
- 10.Symersky J, Osowski D, Walters DE, Mueller DM.Proc Natl AcadSci U S A. 2012 Aug 28;109(35):13961-5. doi: 10.1073/pnas.1207912109. Epub 2012 Aug 6.