البروتينات الرابطة للرنا (غالباً ما يتم اختصارها بRBPs) هي البروتينات التي تربط الحمض النووي الريبوزي المزدوج أو أحادي الخُيَيْطْ[1] مع الخلايا، وتشارك في تشكيل مركبات البروتين النووي، تحتوي RBPs على أشكال بنيوية مختلفة، مثل عزم التعرف على RNA (RRM)، ومجال ربط dsRNA، وإصبع الزنك (zinc finger) وغيرها.[2] وهي بروتينات سيتوبلازمية ونووية. ومع ذلك، فبما أن معظم الحمض النووي الريبوزي الناضج يتم تصديره من النواة بسرعة نسبيا، فإن معظم الـ RBPs في النواة توجد كمركبات بروتينية وpre-mRNA تسمى جزيئات بروتينات الدم غير المتجانسة (hnRNPs).[3]
مقالات ذات صلة
وصلات خارجية
- starBase platform: a platform for decoding binding sites of RNA binding proteins (RBPs) from large-scale CLIP-Seq (HITS-CLIP, PAR-CLIP, iCLIP, CLASH) datasets.
- RBPDB database: a database of RNA binding proteins.
- ATtRACt database: a database of RNA binding proteins and associated motifs.
- SplicedAid-F: a database of hand -cureted human RNA binding proteins database.
- RsiteDB: RNA binding site database
- dRNA-seq: Template-based prediction of RNA binding proteins and their complex structures.
- dRNA-3D: RNA binding proteins prediction from 3D structures.
- ENCODE Project: A collection of genomic datasets (i.e. RNA Bind-n-seq, eCLIP, RBP targeted shRNA RNA-seq) for RBPs
- RBP Image Database: Images showing the cellular localization of RBPs in cells
المراجع
- RNA-Binding Proteins في المَكتبة الوَطنية الأمريكية للطب نظام فهرسة المواضيع الطبية (MeSH).
- Lunde, B. M.; Moore, C; Varani, G (2007). "RNA-binding proteins: Modular design for efficient function". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 8 (6): 479–90. doi:10.1038/nrm2178. PMID 17473849.
- Hogan, Daniel J.; Riordan, Daniel P.; Herschlag, Daniel; Brown, Patrick O.; Brown, Patrick O. (2008). "Diverse RNA-Binding Proteins Interact with Functionally Related Sets of RNAs, Suggesting an Extensive Regulatory System". PLOS Biology. المكتبة العامة للعلوم. 6 (10): e255. doi:10.1371/journal.pbio.0060255. PMC . PMID 18959479.