الرئيسيةعريقبحث

رنا ريبوسومي S5

تمثيل ثلاثي الأبعاد لجزيء رنا ريبوسومي S5. مأخوذة من بنية الوحدة الريبوسومية الفرعية S50 للإشريكية القولونية، ومبنية على المجهر الإلكتروني النافذ.[1]

الرنا الريبوسومي S5 (ARN ribosomique 5S)‏ هو أحد جزيئات الرنا الريبوسومي الصغيرة ويتكون من 121 نوكليوتيد [2] ووزنه 40 كدا، وهو مكون هيكلي ووظيفي للوحدة الفرعية الكبيرة للريبوسوم في جميع نطاقات الحياة (بكتيريا، عتائق وحقيقيات النوى) باستثناء رنا المتقدرة لدى الفطريات والحيوانات.[3] تشير العلامة S5 إلى سرعة التثفل (الترسب) أثناء الطرد المركزي الفائق، والتي تقاس بوحدة سفيدبرغ.[4]

التخليق الحيوي

لدى حقيقيات النوى، يتواجد الرنا 5S عادة في مشغلات الرنا الريبوسومي مع الاتجاه من الرنا الريبوسومي الخاص بالوحدة الفرعية الكبيرة والصغيرة، ويترجمون معا إلى نسخة أولية عديدة السيسترون.[5] ميزة خاصة بجينوم حقيقيات النوى هي تواجدُ عدة جينات مشفِّرة للرنا 5S ‏ (5S rDNA) متجمعة في تكرارات ترادفية، مع كون عددها يختلف من جنس لآخر.[6][7] يُخلَّق الرنا 5S الخاص بحقيقيات النوى بواسطة بوليميراز الرنا 3 في حين أن بقية جزيئات الرنا الريبوسومي الأخرى تُقص من الرنا الأولي 45S المنسوخ بواسطة بوايميراز الرنا 1. في الخلية البيضية للقيطم، تبين أن الأصابع 4-7 من أصابع الزنك التسعة الخاصة بعامل النسخ TFIIIA يمكنها الارتباط بالموقع المركزي للرنا 5S.[8][9] الارتباط بين الرنا 5S وTFIIIA له وظيفتان: الأولى كبت ترجمة المزيد من جين الرنا 5S والثانية ضمان استقرار نسخة الرنا حتى تكون هنالك حاجة إليها عند تجميع الريبوسوم.[10]

البنية

تتكون البنية الثانوية للرنا 5S من خمسة لوالب (يرمز إليها من V-I بالأرقام الرومانية)، أربع حلقات (E-B) ومفصل واحد وتشكل جميع هذه الأنماط البنيوية بنية تشبه حرف Y. الحلقتان C وD هما حلقتان جذعيتان نهائيتان، والحلقتان B وE داخليتان.[6] تبعا لدراسات علم تطور السلالات من الأرجح أن اللولبين I وIII سلفيان (موروث من سلف مشترك).[11] يشمل اللولب III جزيئتي أدينوسين عاليتا الانحفاظ.[12] يُعتقد أن اللولب V -وهو بنية حلقة جذعية- يتآثر مع عامل النسخ TFIIIA.[6]

مراجع

  1. Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 A resolution". J Mol Biol. 298 (1): 35–59. doi:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.
  2. (بالإنجليزية) Homo sapiens RNA, 5S ribosomal 17 (RNA5S17), ribosomal RNA, sur le site du NCBI. نسخة محفوظة 2 فبراير 2018 على موقع واي باك مشين.
  3. (بالإنجليزية) Maciej Szymanski, Miroslawa Z. Barciszewska, Volker A. Erdmann et Jan Barciszewski, « 5S Ribosomal RNA Database », في Nucleic Acid Research, vol. 30, no 1, janvier 2002, ص.  176-178 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 22 août 2014)] 
  4. Szymanski M, Barciszewska MZ, Erdmann VA, Barciszewski J (January 2002). "5S Ribosomal RNA Database". Nucleic Acids Res. 30 (1): 176–8. doi:10.1093/nar/30.1.176. PMC . PMID 11752286.
  5. Kaczanowska, M; Rydén-Aulin, M (September 2007). "Ribosome biogenesis and the translation process in Escherichia coli". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 71 (3): 477–494. doi:10.1128/MMBR.00013-07. PMC . PMID 17804668.
  6. Ciganda, Martin; Williams, Noreen (July 2011). "Eukaryotic 5S rRNA biogenesis". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2 (4): 523–533. doi:10.1002/wrna.74. PMC . PMID 21957041.
  7. Douet, J; Tourmente, S (Jul 2007). "Transcription of the 5S rRNA heterochromatic genes is epigenetically controlled in Arabidopsis thaliana and Xenopus laevis". Heredity. 99 (1): 5–13. doi:10.1038/sj.hdy.6800964. PMID 17487217.
  8. McBryant, SJ; Veldhoen, N; Gedulin, B; Leresche, A; Foster, MP; Wright, PE; Romaniuk, PJ; Gottesfeld, JM (1995). "Interaction of the RNA binding fingers of Xenopus transcription factor IIIA with specific regions of 5 S ribosomal RNA". Journal of Molecular Biology. 248 (1): 44–57. doi:10.1006/jmbi.1995.0201. PMID 7731045.
  9. Searles, MA; Lu D; Klug A (2000). "The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA". J Mol Biol. 301 (1): 47–60. doi:10.1006/jmbi.2000.3946. PMID 10926492.
  10. Pelham, HRB; Brown DD (1980). "A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77 (7): 4170–4174. doi:10.1073/pnas.77.7.4170. PMC . PMID 7001457.
  11. Sun, FJ; Caetano-Anollés, G (Nov 2009). "The evolutionary history of the structure of 5S ribosomal RNA". Journal of Molecular Evolution. 69 (5): 430–43. doi:10.1007/s00239-009-9264-z. PMID 19639237.
  12. DiNitto, JP; Huber, PW (Oct 23, 2001). "A role for aromatic amino acids in the binding of Xenopus ribosomal protein L5 to 5S rRNA". Biochemistry. 40 (42): 12645–53. doi:10.1021/bi011439m. PMID 11601989.

موسوعات ذات صلة :