السودويوريدين (Pseudouridine ) ويختصر بالرمز الإغريقي بسي Ψ [1] هو مماكب نوكليوسيد اليوريدين تكون فيه قاعدة اليوراسيل مرتبطة بالريبوز عن طريق رابطة كربون-كربون بدل الرابطة الغليكوسيدية نيتروجين-كربون (يسمى أحيانا اليوراسيل في هذا التركيب سودويوراسيل) وهو أكثر النوكليوسيدات المعدلة انتشارا من بين المئات الموجودة في الحمض النووي الريبوزي [2]. يوجد Ψ في جميع الأجناس وفي العديد من أنواع الرنا [3][4][5][6] ويتم إنتاجه بواسطة إنزيم يسمى Ψ سينثاز الذي يماكب نوكليوسيدات يوريدين محددة أثناء تعديلات ما بعد النسخ في عملية تسمى السودويوريدينلة (pseudouridylation) [7]. تم حتى الآن تحديد حوالي 9500 تعديل سودويوريدين (Ψ) لدى الثديات والخميرة وتم وضعها في قاعدة بيانات RMBase.[8]
| سودويوريدين | |
|---|---|
 | |
| الاسم النظامي (IUPAC) | |
5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione |
|
| التسمية المفضلة للاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية | |
5-(β-D-ribofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione |
|
| أسماء أخرى | |
psi-Uridine, 5-Ribosyluracil, beta-D-Pseudouridine, 5-(beta-D-Ribofuranosyl)uracil |
|
| المعرفات | |
| رقم CAS | 1445-07-4  |
| بوب كيم (PubChem) | 15047 |
|
|
| الخواص | |
| الصيغة الجزيئية | C9H12N2O6 |
| الكتلة المولية | 244.20 g/mol |
| المظهر | مسحوق حُبَيبي أبيض. |
| الذوبانية في الماء | شديد الذوبان في الماء. |
| في حال عدم ورود غير ذلك فإن البيانات الواردة أعلاه معطاة بالحالة القياسية (عند 25 °س و 100 كيلوباسكال) | |
يتم اصطناع السودويوريدين حيويا بواسطة Ψ سينثاز.
يتواجد عادة في الرنا الناقل مرتبطا مع الثيميدين والسايتوسين في الذراه TΨC وهو أحد مناطق الرنا الناقل غير المتغيرة، وظيفته غير واضحة تماما لكن يُتوقع لعبه دورا مع أمينوسيكل ترانسفيراز أثناء تفاعلهما مع الرنا الناقل ومنه ابتداء الترجمة، تقترح دراسات حديثة أنه يمنح حماية ضد الإشعاعات [9].
مراجع
- IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (1970). "Abbreviations and symbols for nucleic acids, polynucleotides, and their constituents". Biochemistry. 9 (20): 4022–4027. doi:10.1021/bi00822a023. PMC . PMID 5499957.
- Hamma T, Ferré-D'Amaré AR (2006). "Pseudouridine synthases". Chem. Biol. 13 (11): 1125–1135. doi:10.1016/j.chembiol.2006.09.009. PMID 17113994.
- Charette M, Gray MW (2000). "Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why". IUBMB Life. 49 (5): 341–351. doi:10.1080/152165400410182. PMID 10902565.
- Liang XH, Xu YX, MIchaeli S (2002). "The spliced leader-associated RNA is a trypanosome-specific sn(o) RNA that has the potential to guide pseudouridine formation on the SL RNA". RNA. 8 (2): 237–246. doi:10.1017/S1355838202018290. PMC . PMID 11911368.
- Carlile, Thomas (2014-09-05). "Pseudouridine profiling reveals regulated mRNA pseudouridylation in yeast and human cells". نيتشر (مجلة). 515: 143–6. doi:10.1038/nature13802. PMC . PMID 25192136.
- Schwartz, Schraga (2014-09-11). "Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA". Cell. 159: 148–62. doi:10.1016/j.cell.2014.08.028. PMC . PMID 25219674.
- Ferré-D'Amaré AR (2003). "RNA-modifying enzymes". Curr. Opin. Struct. Biol. 13 (1): 49–55. doi:10.1016/S0959-440X(02)00002-7. PMID 12581659.
- Sun, WJ; Li, JH; Liu, S; Wu, J; Zhou, H; Qu, LH; Yang, JH (4 January 2016). "RMBase: a resource for decoding the landscape of RNA modifications from high-throughput sequencing data". Nucleic Acids Research. 44 (D1): D259-65. doi:10.1093/nar/gkv1036. PMC . PMID 26464443.
- Monobe, Manami; Arimoto-Kobayashi, Sakae; Ando, Koichi (2003). "β-Pseudouridine, a beer component, reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes". Mutation Research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis. 538 (1–2): 93–99. doi:10.1016/S1383-5718(03)00094-9. PMID 12834758. مؤرشف من الأصل في 21 نوفمبر 2018. نسخة محفوظة 21 نوفمبر 2018 على موقع واي باك مشين.