الرئيسيةعريقبحث

رنا صغير بكتيري

بنية رنا Qrr الصغير، وظيفته تنظيم استشعار النصاب لدى أجناس بكتيريا الضمة.

الرنا الصغير البكتيري (Bacterial small RNA)‏ هو رنا غير مشفر صغير طوله حوالي 50-100 نوكليوتيد تُنتجه البكتيريا وهو ذو بنية منتظمة للغاية ويحتوي على العديد من الحلقات الجذعية.[1][2] تم تحديد الكثير من جزيئات الرنا الصغيرة باستخدام تقنيات تحليل حاسوبية وتقنيات مخبرية مثل: لطخة نورثرن، المصفوفات الدقيقة، سَلسَلة الرنا [3] في العديد من أجناس البكتيريا بما في ذلك الإشريكية القولونية،[4][5][6] النموذج الممرض من السلمونيلا،[7] بكتيريا سينوريزوبيوم ميليلوتي من عائلة متقلبات ألفا المثبتة للنيتروجين،[8] البكتيريا الزرقاء البحرية،[9] الفرنسيسيلة التولارية (العامل المسبب لداء توليري)،[10]العقدية المقيحة،[11] المكورة العنقودية الذهبية الممرضة،[12] وممرضة النبات المستصفرة الرزية.[13]

يؤثر الرنا البكتيري الصغير على كيفية التعبير عن الجينات داخل الخلايا البكتيرية عبر التآثر مع الرنا الرسول أو البروتين، وبذلك يؤثر على مجموعة متنوعة من الوظائف البكتيرية كالأيض، حدة الجرثوم، الاستجابة للإجهاد البيئي والبنية.[7][12]

مراجع

  1. Vogel J, Wagner EG (June 2007). "Target identification of small noncoding RNAs in bacteria". Curr. Opin. Microbiol. 10 (3): 262–70. doi:10.1016/j.mib.2007.06.001. PMID 17574901.
  2. Viegas SC, Arraiano CM (2008). "Regulating the regulators: How ribonucleases dictate the rules in the control of small non-coding RNAs". RNA Biol. 5 (4): 230–43. doi:10.4161/rna.6915. PMID 18981732.
  3. Wassarman KM, Repoila F, Rosenow C, Storz G, Gottesman S (July 2001). "Identification of novel small RNAs using comparative genomics and microarrays". Genes Dev. 15 (13): 1637–51. doi:10.1101/gad.901001. PMC . PMID 11445539.
  4. Hershberg R, Altuvia S, Margalit H (April 2003). "A survey of small RNA-encoding genes in Escherichia coli". Nucleic Acids Res. 31 (7): 1813–20. doi:10.1093/nar/gkg297. PMC . PMID 12654996.
  5. Rivas E, Klein RJ, Jones TA, Eddy SR (September 2001). "Computational identification of noncoding RNAs in E. coli by comparative genomics". Curr. Biol. 11 (17): 1369–73. doi:10.1016/S0960-9822(01)00401-8. PMID 11553332.
  6. Argaman L, Hershberg R, Vogel J, et al. (June 2001). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Curr. Biol. 11 (12): 941–50. doi:10.1016/S0960-9822(01)00270-6. PMID 11448770.
  7. Vogel J (January 2009). "A rough guide to the non-coding RNA world of Salmonella". Mol. Microbiol. 71 (1): 1–11. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06505.x. PMID 19007416.
  8. Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, et al. (2010). "A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti". BMC Genomics. 11: 245. doi:10.1186/1471-2164-11-245. PMC . PMID 20398411.
  9. Axmann IM, Kensche P, Vogel J, Kohl S, Herzel H, Hess WR (2005). "Identification of cyanobacterial non-coding RNAs by comparative genome analysis". Genome Biol. 6 (9): R73. doi:10.1186/gb-2005-6-9-r73. PMC . PMID 16168080.
  10. Postic G, Frapy E, Dupuis M, et al. (2010). "Identification of small RNAs in Francisella tularensis". BMC Genomics. 11: 625. doi:10.1186/1471-2164-11-625. PMC . PMID 21067590.
  11. Tesorero, Rafael A.; Yu, Ning; Wright, Jordan O.; Svencionis, Juan P.; Cheng, Qiang; Kim, Jeong-Ho; Cho, Kyu Hong (2013-01-01). "Novel regulatory small RNAs in Streptococcus pyogenes". PLOS One. 8 (6): e64021. doi:10.1371/journal.pone.0064021. ISSN 1932-6203. PMC . PMID 23762235.
  12. Felden, Brice; Vandenesch, François; Bouloc, Philippe; Romby, Pascale (2011-03-10). "The Staphylococcus aureus RNome and Its Commitment to Virulence". PLoS Pathogens. 7 (3). doi:10.1371/journal.ppat.1002006. ISSN 1553-7366. PMC . PMID 21423670.
  13. Liang H, Zhao YT, Zhang JQ, Wang XJ, Fang RX, Jia YT (2011). "Identification and functional characterization of small non-coding RNAs in Xanthomonas oryzae pathovar oryzae". BMC Genomics. 12: 87. doi:10.1186/1471-2164-12-87. PMC . PMID 21276262.

موسوعات ذات صلة :