FCporto

Le 22 mai 2016, il inscrit un doublé en finale de la Coupe du Portugal contre l'équipe du SC Braga. Malgré tout, le FC Porto s'incline aux tirs au but après un score de deux buts partout^[3].

André Silva inscrit son premier but en Ligue des champions le 17 août 2016, sur penalty, contre le club italien de l'AS Rome en match de barrage (score : 1-1)^[4].

AC Milan (2017-2020)

Le 12 juin 2017, peu après l'ouverture du mercato italien, André Silva s'engage avec l'AC Milan pour un montant de 38 millions d'euros et un contrat portant sur cinq années au club^[5]. André Silva devient la recrue la plus chère de l'histoire du club derrière Rui Costa (un autre international portugais)^[6]. Après sa signature, il déclare à la presse : « Je suis très heureux d'avoir rejoint un club aussi prestigieux avec une aussi belle histoire »^[7]. Il devait recevoir le maillot floqué du numéro 10 (laissé vacant par Keisuke Honda)^[7], mais après la signature d'Hakan Çalhanoğlu le 3 juillet 2017^[8], il se voit finalement attribué le maillot floqué du numéro 9 (laissé vacant par Gianluca Lapadula)^[9].

Le 22 juillet 2017, il dispute son premier match avec le club : une rencontre d'International Champions Cup face au Bayern Munich, qui se solde par une large victoire des Rossoneri (0-4)^[10]. Un match durant lequel il aurait pu marquer seulement quelques minutes après son entrée en jeu : à la réception d'un centre de Fabio Borini à la 53^e minute, sa reprise passe à côté du cadre^[11].

Il marque son premier but avec le club le 9 août 2017, en transformant un penalty lors d'un match amical face au Betis Séville (défaite 1-2)^[12]. Son premier but en compétition officielle intervient quant à lui une semaine plus tard lorsque le 17 août 2017, il ouvre le score face au KF Shkëndija après 13 minutes de jeu, dans le cadre d'un match de barrage pour participer à l'édition 2017-2018 de la Ligue Europa^[13]. Lors de ce match, remporté 6-0, il inscrit également un deuxième but (à la 27^e minute après que Riccardo Montolivo, lui aussi auteur d'un doublé ce jour-là, ait fait le break) et délivre une passe décisive pour Fabio Borini^[14].

Le 14 septembre 2017, pour son premier match de Ligue Europa, il réalise un hat-trick en marquant trois buts à l'extérieur contre l'Austria Vienne (victoire 1-5)^[15], devenant ainsi le premier joueur du Milan a inscrire un triplé dans une compétition européenne depuis Kaká^[16], auteur d'un triplé contre Anderlecht lors d'un match de Ligue des champions le 1^er novembre 2006. Cette performance lui permet de figurer dans l'équipe-type de la semaine concoctée par l'UEFA^[17].

Le 11 mars 2018, il inscrit son premier but en Serie A, en marquant de la tête à la dernière minute contre le Genoa, donnant ainsi la victoire à son équipe (0-1)^[18]. Une victoire (très) importante, puisqu'elle permet au Milan (alors septième) d'accrocher momentanément la sixième place du classement qui offre une qualification directe en Ligue Europa pour la saison suivante. Cependant, ses performances en championnat sont loin d'êtres bonnes (2 buts en 24 matchs), ce qui pousse l'avant-centre portugais vers la sortie lors du mercato estival (notamment à cause de la concurrence avec Patrick Cutrone et la future recrue du club Gonzalo Higuaín), malgré les désirs du club de le garder^[19].

Le 5 août 2018, lors d'un match d'International Champions Cup, qui oppose l'AC Milan au FC Barcelone, il inscrit le but de la victoire (1-0) dans le temps additionnel^[20].

Prêt au Séville FC

Le 11 août 2018, André Silva est prêté au Séville FC^[21].

Le 19 août 2018, pour son premier match de Liga, il s'offre un triplé (le premier de la saison) face au Rayo Vallecano, lors d'un match à l'extérieur gagné 1-4^[22]. Il devient ainsi le premier joueur à réussir cet exploit depuis Romário^[23], lui aussi auteur d'un triplé pour son premier match de Liga face à la Real Sociedad lors de la saison 1993-1994.

Le 26 septembre 2018, il inscrit un doublé contre le Real Madrid, lors d'un match à domicile, gagné 3-0.

Le 25 novembre 2018, André Silva marque le but de la victoire lors d'une rencontre à domicile face au Real Valladolid (1-0), permettant ainsi au Séville FC de s'emparer momentanément de la première place du classement, au nez et à la barbe du FC Barcelone pour la troisième fois de la saison.