الرئيسيةعريقبحث

دنا ب

بنية متحركة للدنا ب.

الدنـا ب (B-DNA)‏ أو الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ب هو البنية الأكثر شيوعا التي يتخذها اللولب المزدوج للدنا، اقترحت سنة 1953 بواسطة فرنسيس كريك وجيمس واتسون.[1]

البنية

البنية ب يمينية الاتجاه وتمتاز بقطر يبلغ حوالي 2.37 نانومتر وبعد بين أزواج القواعد يقدر بـ 0.34 نانومتر وميلان شبه عمودي على محور اللولب المزدوج (−1,2°)، وتحوي كل دورة للولب المزدوج بين 10.4 إلى 10.5 زوج قاعدي في المحاليل، تحتوي البنية ب على ثلمين غير متساويين طول الكبير 2.2 نانومتر والصغير 1.2 نانومتر [2]. ونتيجة لذلك فإنه يمكن الوصول للقواعد النووية بشكل أكبر من الخارج في الثلم الكبير وفي العادة هذا هو المكان الذي تختار البروتينات (مثل بروتينات النسخ) أن ترتبط فيه مع سلسلة الدنا.[3].

مقارنة بين الأشكال الرئيسية الثلاث

من اليسار إلى اليمين: هيئة الدنا أ، هيئة الدنا ب وهيئة الدنا ز.
الخصائص الهيكلية لأشكال الدنا الرئيسية الثلاث للولب المزدوج[4] · [5] · [6]
خصائص دنا أ دنا ب دنا ز
اتجاه اللولب المزدوج يمين يمين يسار
تكرار الوحدة 1 bp 1 bp 2 bp
زاوية دوران اللولب المزدوج لكل زوج قاعدي 32,7° 34,3° 60°/2
عدد الأزواج القاعدية لكل دورة للولب المزدوج 11 10,5 12
السن اللولبي للولب المزدوج لكل دورة 2.82 نانومتر 3.32 نانومتر 4.56 نانومتر
البعد بين القواعد داخل اللولب المزدوج 0.26 نانومتر 0.34 نانومتر 0.37 نانومتر
القطر 2.3 نانومتر 2.0 نانومتر 1.8 نانومتر
انحناء الأزواج القاعدية بالنسبة لمحور اللولب المزدوج +19° −1,2° −9°
متوسط الالتواء (propeller twist) +18° +16° 0°
اتجاه القواعد بالنسبة للسكر عكس عكس بيريميدين : عكس
بيورين : مع
انحناء روابط ذرات السكر
(Sugar pucker)		 'C3-إندو 'C2 - إندو سايتوسين : 'C2 - إندو
غوانين : 'C2 - إكسو

مراجع

  1. Richmond; Davey, CA; et al. (2003). "The structure of DNA in the nucleosome core". Nature. 423 (6936): 145–150. Bibcode:2003Natur.423..145R. doi:10.1038/nature01595. PMID 12736678.
  2. Richard Wing, Horace Drew, Tsunehiro Takano, Chris Broka, Shoji Tanaka, Keiichi Itakura et Richard E. Dickerson, « Crystal structure analysis of a complete turn of B-DNA », في Nature, vol. 287, no 5784, 23 octobre 1980, ص.  755-758 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 13-02-2018)] 
  3. C. O. Pabo et R. T. Sauer, « Protein-DNA Recognition », في Annual Review of Biochemistry, vol. 53, juillet 1984, ص.  293-321 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 13-02-18)] 
  4. DNA structure and function. Academic Press. 1994-01-15.  .
  5. Rich A, Norheim A, Wang AHJ. "The chemistry and biology of left-handed Z-DNA". Annual Review of Biochemistry. 53: 791–846. doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043. PMID 6383204.
  6. Ho PS (1994-09-27). "The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA". Proc Natl Acad Sci USA. 91 (20): 9549–9553. Bibcode:1994PNAS...91.9549H. doi:10.1073/pnas.91.20.9549. PMC . PMID 7937803.

موسوعات ذات صلة :