الدنـا ز (Z-DNA) أو الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ز هو أحد الأشكال التي يتخذها اللولب المزدوج للدنا وهو يساري الإتجاه (عكس الدنا ب الأكثر شيوعا) حيث تلتف سلسلتا لولبه المزدوج حول المحور بنمط متعرج، ويعتقد أن الدنا ز أحد ثلاثة أكثر هياكل اللولب المزدوج نشاطا رفقة الدنا أ والدنا ب.
البنية
تختلف بنية الدنا ز عن البنيات اليمينية، في الواقع عادة ما تتم مقارنتها مع الدنا ب لتوضيح الاختلافات الكبيرة. الدنا ز يساري الاتجاه ولديه بنية تتكرر كل 2 من القواعد الزوجية. عكس الدنا أ وب الثلمان الكبير والصغير في الدنا ز يظهران اختلافا صغيرا في العرض. تَشكُلُ هذه البنية في الغالب غير ملائم إلا أن بعض الظروف قد تؤدي إلى ذلك مثل: تناوب التسلسل بيورين-بيريميدين (خاصة متعدد 2(dGC))، لف الدنا الفائق السلبي أو الوسط العالي الملوحة أو الكاتيونات (جميعها في درجة الحرارة 37 °C، وpH 7.3-7.4). يمكن للدنا ز تكوين نقاط اتصال مع الدنا ب في بنية يتم فيها دفع أزواج قاعدية للخارج.[1]
هيئة الدنا ز صعبة الدراسة لأنها لا توجد كأحد الهيئات المستقرة للولب المزدوج وإنما هي بنية انتقالية تظهر أحيانا نتيجة وظيفة بيولوجية ما ثم تختفي بسرعة.[2]
مقارنة بين الأشكال الرئيسية الثلاث
| خصائص | دنا أ | دنا ب | دنا ز |
|---|---|---|---|
| اتجاه اللولب المزدوج | يمين | يمين | يسار |
| تكرار الوحدة | 1 bp | 1 bp | 2 bp |
| زاوية دوران اللولب المزدوج لكل زوج قاعدي | 32,7° | 34,3° | 60°/2 |
| عدد الأزواج القاعدية لكل دورة للولب المزدوج | 11 | 10,5 | 12 |
| السن اللولبي للولب المزدوج لكل دورة | 2.82 نانومتر | 3.32 نانومتر | 4.56 نانومتر |
| البعد بين القواعد داخل اللولب المزدوج | 0.26 نانومتر | 0.34 نانومتر | 0.37 نانومتر |
| القطر | 2.3 نانومتر | 2.0 نانومتر | 1.8 نانومتر |
| انحناء الأزواج القاعدية بالنسبة لمحور اللولب المزدوج | +19° | −1,2° | −9° |
| متوسط الالتواء (propeller twist) | +18° | +16° | 0° |
| اتجاه القواعد بالنسبة للسكر | عكس | عكس | بيريميدين : عكس بيورين : مع |
| انحناء روابط ذرات السكر (Sugar pucker) |
'C3-إندو | 'C2 - إندو | سايتوسين : 'C2 - إندو غوانين : 'C2 - إكسو |
مراجع
- de Rosa M, de Sanctis D, Rosario AL, Archer M, Rich A, Athanasiadis A, Carrondo MA (2010-05-18). "Crystal structure of a junction between two Z-DNA helices". Proc Natl Acad Sci USA. 107 (20): 9088–9092. Bibcode:2010PNAS..107.9088D. doi:10.1073/pnas.1003182107. PMC . PMID 20439751.
- Zhang H, Yu H, Ren J, Qu X (2006). "Reversible B/Z-DNA transition under the low salt condition and non-B-form polydApolydT selectivity by a cubane-like europium-L-aspartic acid complex". Biophysical Journal. 90 (9): 3203–3207. Bibcode:2006BpJ....90.3203Z. doi:10.1529/biophysj.105.078402. PMC . PMID 16473901. مؤرشف من الأصل في 12 أكتوبر 2008.
- DNA structure and function. Academic Press. 1994-01-15. .
- Rich A, Norheim A, Wang AHJ. "The chemistry and biology of left-handed Z-DNA". Annual Review of Biochemistry. 53: 791–846. doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043. PMID 6383204.
- Ho PS (1994-09-27). "The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA". Proc Natl Acad Sci USA. 91 (20): 9549–9553. Bibcode:1994PNAS...91.9549H. doi:10.1073/pnas.91.20.9549. PMC . PMID 7937803.