علم الوراثة السمي ( Toxicogenomics) هو ذلك الفرع من العلم الذي يهتم بتجميع، وتفسير، وتخزين المعلومات حول الجينات ونشاط البروتين داخل خليةٍ معينةٍ أو نسيجٍ داخل الكائنات الحية في استجابةٍ منها للمواد السامة. ومن ثم فعلم الوراثة السمي يجمع في طياته دراسة كلٍ من علم السموم وعلم الجينوم (genomics) أو تقنيات التنميط الجزيئي عالية الإنتاجية الأخرى مثل نسخيات (transcriptomics)، البروتيوميات واستقلابيات ( metabolomics)[1][2]. حيث يسعى علم الوراثة السمي إلى توضيح الآليات الجزيئية المشاركة في التعبير عن التسمم، بالإضافة إلى سعيه إلى اشتقاق نماذج التعبير الجزيئي (ومنها على سبيل المثال المؤشرات الحيوية الجزيئية) والتي تتنبأ بالتسمم أو القابلية الوراثية الجينية لحدوثه.
هذا ويُعَرَّف علم الوراثة السمي في نطاق البحث الصيلاني على أنه دراسة بنية ووظيفة الجينوم من حيث استجابته للتعرض أو تلقي أية جرعات حيوية متنوعة. فهو عبارة عن التنظيم الفرعي السمي لعلم الصيدلة الجيني، والذي يُعَّرَفُ بصورةٍ أوسع وأكثر عموماً على أنه دراسة التنوعات الداخلية الفردية في الجينوم ككل أو الخرائط متعددة الأشكال لنيكلوتيدات الجين الفردية، محددات الأنماط الفردية، والتغيرات والتحولات في التعبير الجيني والذي قد يرتبط مع الاستجابات لتناول الأدوية (Lesko and Woodcock 2004, Lesko et al. 2003). فعلى الرغم من أن مصطلح علم الوراثة السمي ظهر لأول مرةٍ في أدبيات عام 1999 (Nuwaysir et al.)، إلا أنه كان بالفعل شائع الاستخدام ضمن نطاق الصناعات الدوائية حيث اشتقت أصوله عبر تسويق المخططات من شركات البيع. إلا أن المصطلح ما زال غير مقبولٍ عالمياً، حيث عرض الكيرون مصطلحاتٍ أخرى لوصف نفس المجال بصورةٍ جوهريةٍ (Fielden et al., 2005).
كما تتطلب طبيعة تعقد البيانات (في الكمية والتنوع) عملياتٍ أكثر تطوراً من أجل مرحلتي المعالجة والتخزين اليدويتين. وغالباً ما تتضمن مرحلة التحليل نسقاً عريضاً من البنية المعلوماتية الحياتية (البيولوجية) و الإحصائيات، [3] والتي تشمل بانتظام منهجيات التصنيف [4].
ويستخدم علم الوراثة السمي في مجالي اكتشاف الدواء (Drug discovery) الصيدلي وتطويره (Drug development)لدراسة التأثيرات العكسية ( Adverse effect (medicine)) ومنها تأثيرات و تسمم الأدوية الصيدلانية في الأنظمة الحية النموذجية (model organism)، وذلك بهدف تحديد الخلاصة بالنسبة لمرضى المخاطر التسممية أو حتى البيئة. مما دعى كلاً من وكالة حماية البيئة الأمريكية وإدارة الغذاء والدواء الأمريكية مؤخراً إلى منع وإعاقة صنع القرارات التشريعية والتنظيمية على علم الجينوميات وحده. هذا وتتدارس كلتا الوكالتين استخدام البيانات الواردة لكل حالةٍ على حدةٍ للأغراض التقييمية ( ومثال ذلك للمساعدة في توضيح آلية العملية أو المساهمة المقدمة لنهج الوزن إلى الدليل) أو من أجل تعداد قواعد البيانات المقارنة ذات الصلة بالمجال من خلال تشجيع التعرض المتوازي لبيانات الجينومات أو نتائج اختبار التسمم التقليدي[5].
مشاريع علم الوراثة السمي العامة
- مشروع (التأثيرات الكيميائية في الأنظمة الحيوية) – وهو مشروع يستضيفه المعهد القومي لعلوم الصحة البيئية (National Institute of Environmental Health Sciences) حيث يقوم ببناء وإنشاء قاعدة بينات معرفية حول دراسات علم السميات والتي منها دراسة بيانات التصميم، الباثولوجيا السريرية، علم الأمراض النسيجي، وعلم الوراثة السمي [6].
- يقوم InnoMed PredTox بتقييم قيمة دمج نتائج تقنيات الأوميات (حقيقيات النوى ( omics)) معاً مع النتائج من أكثر طرق علم السموم التقليدية في أكثر عمليات صنع القرارات تشكيلاً في تقويم السلامة قبل السريرية [7].
- جمعية اختبار السلامة التنبؤية الهادفة إلى تحديد واعتماد المؤشرات الحيوية للسلامة سريرياً، من أجل الاستخدام المنتظم كجزءٍ من مبادرة المسار الناقد لإدارة الغذاء والدواء الأمريكية [7].
- برنامج ToxCast للتنبؤ بالمخاطر، تشخيص مسارات التسمم، وإعطاء الأولوية لاختبار سمية المواد الكيميائية البيئية في وطالة حماية البيئة الأمريكية (United States Environmental Protection Agency) [8].
المصادر
- The National Academies Press: Communicating Toxicogenomics Information to Nonexperts: A Workshop Summary (2005) [1] - تصفح: نسخة محفوظة 24 مايو 2013 على موقع واي باك مشين.
- ed. by Hisham K. Hamadeh; Cynthia A. Afshari. (2004). Hamadeh HK, Afshari CA (المحرر). Toxicogenomics: Principles and Applications. Hoboken, NJ: Wiley-Liss. .
Omenn GS (2004). "Book Review: Toxicogenomics: Principles and Applications". Environ Health Perspect. 112 (16): A962. PMC . - Mattes WB, Pettit SD, Sansone SA, Bushel PR, Waters MD (2004). "Database development in toxicogenomics: issues and efforts". Environ. Health Perspect. 112 (4): 495–505. PMC . PMID 15033600. مؤرشف من الأصل في 28 مايو 2010.
- Ellinger-Ziegelbauer H, Gmuender H, Bandenburg A, Ahr HJ (2008). "Prediction of a carcinogenic potential of rat hepatocarcinogens using toxicogenomics analysis of short-term in vivo studies". Mutat. Res. 637 (1–2): 23–39. doi:10.1016/j.mrfmmm.2007.06.010. PMID 17689568.
- Corvi R, Ahr HJ, Albertini S; et al. (2006). "Meeting report: Validation of toxicogenomics-based test systems: ECVAM-ICCVAM/NICEATM considerations for regulatory use". Environ Health Perspect. 114 (3): 420–9. doi:10.1289/ehp.8247. PMC . PMID 16507466. مؤرشف من الأصل في 19 يناير 2009.
- Collins BC, Clarke A, Kitteringham NR, Gallagher WM, Pennington SR (2007). "Use of proteomics for the discovery of early markers of drug toxicity". Expert Opin Drug Metab Toxicol. 3 (5): 689–704. doi:10.1517/17425225.3.5.689. PMID 17916055.
- Mattes WB (2008). "Public consortium efforts in toxicogenomics". Methods Mol Biol. 460: 221–38. doi:10.1007/978-1-60327-048-9_11. PMID 18449490.
- Dix DJ, Houck KA, Martin MT, Richard AM, Setzer RW, Kavlock RJ (2007). "The ToxCast program for prioritizing toxicity testing of environmental chemicals". Toxicol. Sci. 95 (1): 5–12. doi:10.1093/toxsci/kfl103. PMID 16963515.
انظر أيضاً
وصلات خارجية
- قاعدة بيانات علم الوراثة السمي المقارن – قاعدة بيانات عامة تدمج بيانات علم الوراثة السمي للمواد الكيميائية، الجينيات، والأمراض من الأدبيات العلمية.
- مركز أبحاث علم السموم البيئي والوظيفي المحدد من قِبَل مراكز أبحاث CROET: علم الوراثة السمي (العصبي) ومركز أبحاث صحة الطفل.
- InnoMed PredTox – الموقع الإلكتروني الرسمي للمشروع.
- مركز علم الوراثة السمي الهولندي - الموقع الإلكتروني الرسمي للمشروع.
- ToxCast - الموقع الإلكتروني الرسمي للمشروع.